박사면뭐해

생물정보학에서 RMSD는 단백질의 구조적 alingment에서 원자 간 평균 거리에 대한 측정값입니다. RMSD 계산은 생체분자와 같은 비단백질 분자에도 적용할 수 있습니다. 단백질 입체구조 연구에서 두 개의 단백질이 최적의 위치를 가질 때 탄소 원자들의 위치에 대한 RMSD를 통해 3차원 구조의 유사성을 측정할 수 있습니다. 일반적으로 RMSD는 두 개 이상의 단백질간 구조의 유사도를 양적으로 측정하는 데 사용됩니다. 예를 들어 CASP protein structure prediction 대회(단백질의 구조를 예측하는 대회)에서 RMSD는 하나의 평가 지표로 사용됩니다. RMSD가 낮을수록 표적 구조와 비교해서 좋은 모델이 됩니다. 컴퓨터로 단백질 접힘(protein folding)을 연구하는 과학자들..