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박사면뭐해
InterProScan 실행 시 확인해야 할 것들 본문
단백질 서열의 Asterisk (*)는 STOP Codon을 나타내는데, 이게 FASTA 파일안에 포함되어 있으면, InterProScan이 돌아가지 않음.
처음 설치시 dataset이 제대로 complie이 안될 수 있는데, 이 때 data 디렉토리 안에 있는 data들의 경로를 살펴보고 수정후 compile을 해주어야함 (※디렉터리명이 제대로 되어있는지 확인 필수)
bin/hmmer/hmmer3/3.3/hmmpress -f data/gene3d/4.2.0/gene3d_main.hmm
bin/hmmer/hmmer3/3.3/hmmpress -f data/hamap/2020_01/hamap.hmm.lib
bin/hmmer/hmmer3/3.3/hmmpress -f data/panther/15.0/panther.hmm
bin/hmmer/hmmer3/3.3/hmmpress -f data/pfam/33.1/pfam_a.hmm
bin/hmmer/hmmer3/3.1b1/hmmpress -f data/sfld/4/sfld.hmm
bin/hmmer/hmmer3/3.1b1/hmmpress -f data/superfamily/1.75/hmmlib_1.75
bin/hmmer/hmmer3/3.3/hmmpress -f data/tigrfam/15.0/TIGRFAMs_HMM.LIB
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